根据实际问题需求，服务器的部署大致如下：
中转服务器：ssh连接的入口服务器。该服务器对外开放ssh服务端口，ssh访问网内其他服务器必须经过此服务器。由于认证的需求，该服务器系统为桌面版，方面GUI方式的登陆认证。为了解决主机间账号管理问题，可在该机器上安装NIS和NFS服务。通过NIS服务，加入NIS域的主机可以复用同一套用户名和密码，免去了在每台主机上为用户创建账号的麻烦。开启NFS服务，可将用户的文件统一挂载到同一台服务器上，用户访问到不同主机的时候家目录的使用同一个。由于中转服务器可能会暴露在外网，最好开启iptable和selinux。
计算服务器：程序计算的服务器，提供计算资源。用户可通过中转服务器登陆到系统，然后再登陆到计算服务器上提交计算任务。计算服务器类似于lvs,对外表现为单一计算能力。可使用自动化的任务管理体系，将用户提交的任务自动运行。中转服务器和计算服务器各主机之间建议采用公钥登陆认证方式，避免登陆到不同主机时需要输入密码。
WEB服务器：对外提供诸如web或者FTP服务。由于web服务的敏感性和安全问题，建议该服务器使用自己的NIS域，其自身应自立成独立的生态系统。其账户密码以及备份等都应在自有的NIS域或者冗余服务器来解决需求。由于web服务的高危险，强烈建议服务器开启iptable和selinux。
如此的架构将大致满足目前的需求，并且网络拓扑简单。